A) 가 있었다は「(その時、そこに) 既に行っていた」の意味で갔었다は過去完了、「ある時、そこに行った、もしくは行ったことがある」の意味です。갔다は過去形でただ「行った」の意味ですので、３つの意味は違います。
例文）
① 데이트 약속을 했을 땐 남자가 먼저 가 있어야지!（デートの約束だと男が先に行っていないと・着いて待たないと！）
② 어제 철수 씨가 돌아가신 어머니 산소에 갔었다고 해요(昨日チョルスさんが亡くなったお母さんのお墓まいりに行ったそうです／すでに完了の状態）
③ 여기는 드라마 촬영지로 유명해서 많은 관광객이 다녀갔다（ここはドラマのロケ地で有名で多くの観光客が行ってきた・立ち寄った／観光客は今も来る可能性がある）
※ 갔었다は過去完了なので「もう行きません」というニュアンスが少し入ります。갔다は過去のことですが、今も行っている可能性はあります。また、過去のことを思い出しながら、強調の感じで었を重ねて使う時もあります。
例）그를 사랑했었지(今は愛してない)
그를 사랑했어(今も愛してる可能性が高い)