まず「할 거예요」には二つの意味があり、「～するつもりです」と意思を表したり、「～でしょう、～と思います」と推測の意味を表したりします。（今回の例文は「つもり」のほうだけ扱いますね。）
一方「하는 거예요」は「～するんです、～すること（もの）です」の意味で、現在の状況や方法などを説明する時に使います。
例文：
①
A:너는 어디서 공부할 거니?（お前はどこで勉強するつもりなの？）
B:저는 집에 가서 공부할 거예요.（私は家に帰って勉強するつもりです。）
②
A:너는 언제 공부할 거니?（お前はいつ勉強するつもりなの？）
B:저는 지금 공부하는 거예요. （私はいま勉強してるんです。）
③내일 같이 밥을 먹을 거예요.（明日一緒にご飯を食べるつもりです。）
④치킨은 손으로 먹는 거예요.（チキンは手で食べるものです。）
⑤어떻게 할 거예요?（どうするつもりですか？）
⑥어떻게 하는 거예요?（どうやってやるんですか？）
例文を比較すると分かりやすいですね。
参考になさってください
